정렬된 RNA-seq BAM 파일에서 유전자 또는 전사체 수준의 TPM(백만 개당 전사체 수) 값을 효율적으로 계산하여 유전자 발현량 비교에 활용하는 정량 분석 도구.

RNA-seq 및 DNA-seq 데이터를 위한 빠른 리드 정렬, 피처 카운팅, 유전자 발현 정량화 등을 수행하는 고성능 유전체 분석 도구 세트로, 다양한 하위 모듈 제공.

RNA-seq 정렬 데이터를 기반으로 새로운 전사체를 조립하고 발현량을 정량화하며, 알려진 유전자 주석과 결합하여 정확한 전사체 구조를 복원하는 도구.

RNA-Seq 시퀀싱 데이터를 기반으로 유전자와 아이소폼 수준에서의 발현량을 정확하게 추정하며, 정량 분석 및 차등 발현 분석의 기초 자료로 활용되는 도구.