SAM, BAM, CRAM 형식의 유전체 정렬 데이터를 필터링, 정렬, 인덱싱, 통계 분석 등 다양한 방식으로 조작하고 처리하는 표준 명령줄 기반의 분석 도구 모음.

중복 제거, 리드 정렬, 인덱싱, BAM 파일 정리 등 고처리량 시퀀싱 데이터를 전처리하고 조작하기 위한 다양한 Java 기반 명령줄 도구를 포함하는 유틸리티 모음.

SAM, BAM, CRAM, VCF, BCF 등 고속 시퀀싱 데이터를 저장하는 유전체 파일 포맷을 처리하기 위한 C 기반 라이브러리로, 파일 입출력과 압축, 인덱싱 기능을 제공.

대규모 염기서열 데이터에서 유사한 서열을 기준 유사도에 따라 빠르게 클러스터링하고 중복을 제거하여 서열의 다양성과 대표성을 유지하는 데 활용되는 고속 서열 클러스터링 도구.

대용량 FASTA 형식의 서열 파일을 인덱싱하고 cdbyank와 함께 특정 서열 또는 범위를 빠르게 검색할 수 있도록 지원하는 경량 서열 인덱싱 및 추출 도구.

BED, GFF, VCF 등 다양한 포맷의 유전체 특징 간 교차, 병합, 분할, 서브셋 추출 등 복잡한 연산을 빠르고 효율적으로 수행하는 범용 유전체 분석 도구 모음.

BED, GFF, VCF 등 다양한 포맷의 유전체 특징 간 교차, 병합, 분할, 서브셋 추출 등 복잡한 연산을 빠르고 효율적으로 수행하는 범용 유전체 분석 도구 모음.

다양한 필터링, 정렬, 병합, 통계, 변환 및 서브셋 추출 기능을 지원하며 BAM 파일을 정밀하게 조작하고 효율적으로 분석할 수 있도록 돕는 C++ 기반 고성능 명령줄 도구 모음.