HISAT-3N
3-뉴클레오타이드 변환 기반 알고리즘을 통해 비스울파이트 및 다양한 염기 치환 시퀀싱 데이터를 정밀하게 정렬하며, 에피제네틱 변형 분석에 최적화된 고속 정렬 도구.
Bismark
비스울파이트 처리된 시퀀싱 데이터를 기준 유전체에 정렬하고, 시토신 메틸화 상태를 정확히 판별하여 CpG, CHG, CHH 컨텍스트에서 메틸화 패턴을 분석하는 고정밀 메틸화 분석 도구.
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