sra-tools
NCBI의 Sequence Read Archive(SRA)에서 제공하는 시퀀싱 데이터를 다운로드하고, FASTQ 파일로 변환하거나 직접 분석에 활용할 수 있도록 전처리하는 통합 도구 모음.
gffread
GFF 또는 GTF 형식의 유전자 주석 파일에서 전사체 정보를 추출하고, 정확도 검증과 형식 변환, 선택적 필터링, FASTA 출력 등 다양한 후처리 기능을 제공하는 다용도 유틸리티.
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