mothur
16S rRNA와 같은 마커 유전자를 기반으로 미생물군집 시퀀싱 데이터를 전처리, 정렬, OTU 분류, 다양도 분석까지 통합적으로 수행하는 대표적인 분석 도구.
Bracken
Kraken 분류 결과를 기반으로 메타게놈 샘플 내 종 또는 속 수준의 풍부도를 정밀하게 재추정하며, 오분류 교정을 통해 정확한 미생물 군집 구조를 분석할 수 있는 통계 기반 풍부도 추정 도구.
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