STAR
RNA-seq 데이터를 대상으로 스플라이싱 이벤트를 정확히 탐지하며, 고속 정렬 기능을 통해 대용량 유전체 분석에 적합한 초고속 RNA-seq 정렬 도구로 널리 활용됨.
HISAT2
짧은 리드 기반 RNA-Seq 데이터를 고속으로 처리하며, 스플라이싱 정보를 반영한 정확한 정렬을 지원하고 메모리 효율이 뛰어난 차세대 염기서열 정렬 도구.
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