QualiMap
NGS 정렬 데이터를 기반으로 염기 커버리지, GC 바이어서, 매핑 품질 등을 정량적으로 분석하고 다양한 그래프 및 리포트를 통해 시각적으로 품질을 평가하는 도구.
Merqury
k-mer 기반 분석을 활용하여 참조 유전체 없이도 de novo 조립된 유전체의 정확도, 완성도, 상동성 등을 정량적으로 평가할 수 있는 비참조 품질 평가 도구.
BUSCO
진화적으로 보존된 단일사본 직교 유전자의 존재 여부를 기반으로 유전체, 전사체, 단백질 서열의 주석 완성도와 품질을 정량적으로 평가하는 표준화된 유전체 완성도 평가 도구.
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