Roary
수천 개의 박테리아 유전체에서 유전자 군집을 빠르게 식별하고 core 및 accessory 유전자를 비교 분석하여 pan-genome 구조를 체계적으로 구축하는 파이프라인.
MUMmer
서로 다른 유전체 간의 전체 서열을 고속으로 정렬하고 유사성과 구조적 차이를 시각화하여 비교 유전체 분석에 활용되는 대표적인 서열 정렬 도구.
MaAsLin2
인구 규모의 메타지놈 또는 메타오믹스 데이터를 대상으로 다양한 임상 및 환경 변수와의 통계적 연관 분석을 수행하는 다변량 모델 기반 통합 분석 도구.
Dsuite
D-통계 및 다양한 계통유전학 기반 통계 분석을 통해 개체군 간 유전자 흐름, 혼합, 계통 왜곡의 정량화 및 시각화를 수행하여 복잡한 진화 양상을 해석하는 데 활용되는 분석 도구.
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