Illumina NGS 데이터를 대상으로 품질 점수 기반 트리밍, 어댑터 제거, 길이 필터링 등을 지원하며, 다양한 분석 파이프라인에 활용되는 유연하고 강력한 전처리 도구.

Cutadapt과 FastQC를 기반으로 시퀀싱 리드에서 어댑터 서열 제거와 품질 기반 트리밍을 자동 수행하여 전처리 품질을 표준화하는 NGS 전처리 통합 도구.

시퀀싱 데이터를 바탕으로 샘플 간의 유전적 유사성 및 일치 여부를 평가하고, 샘플 간 관계 분석이나 오류 탐지에 유용하게 활용되는 NGS 기반 유전체 분석 도구.

Next-Generation Sequencing 데이터에서 품질 점수가 낮은 염기를 기반으로 리드를 트리밍하여 후속 분석의 정확도를 높이는 데 활용되는 간단하고 빠른 전처리 도구.

NGS 정렬 데이터를 기반으로 염기 커버리지, GC 바이어서, 매핑 품질 등을 정량적으로 분석하고 다양한 그래프 및 리포트를 통해 시각적으로 품질을 평가하는 도구.

k-mer 기반 분석을 활용하여 참조 유전체 없이도 de novo 조립된 유전체의 정확도, 완성도, 상동성 등을 정량적으로 평가할 수 있는 비참조 품질 평가 도구.

NGS 시퀀싱 결과로 생성된 FASTA 및 FASTQ 형식의 리드 데이터를 대상으로 필터링, 트리밍, 변환 등 다양한 전처리 작업을 명령줄 기반으로 수행하는 도구 모음.

시퀀싱된 NGS 데이터의 전체 품질을 종합적으로 평가하며, 염기별 품질, GC 함량, 중복도, 어댑터 오염 등 다양한 품질 지표를 시각적으로 제공하는 품질 관리 도구.

시퀀싱된 FASTQ 데이터를 대상으로 어댑터 제거, 트리밍, 필터링, 오류 수정, 품질 통계 생성 등 다양한 전처리 작업을 고속으로 수행하는 통합형 품질 관리 도구.

진화적으로 보존된 단일사본 직교 유전자의 존재 여부를 기반으로 유전체, 전사체, 단백질 서열의 주석 완성도와 품질을 정량적으로 평가하는 표준화된 유전체 완성도 평가 도구.

정렬된 BAM 파일에서 특정 염기 위치의 리드 수, 염기 비율, 품질, 인서션 및 딜리션 정보를 정량적으로 계산하고 변이 감지 및 시퀀싱 깊이 해석에 활용하는 분석 도구.